Filwaqt li l-membrani tar-reverse osmosis jisbqu fit-tneħħija tal-batterji, xorta għandhom xi limitazzjonijiet. Pereżempju, il-fouling tal-membrana hija problema komuni; batterji u mikro-organiżmi oħra jistgħu jiffurmaw bijofilms fuq il-wiċċ tal-membrana, li jwasslu għal tnaqqis fil-fluss u żieda fil-konsum tal-enerġija. Il-proċess tar-reverse osmosis jipproduċi wkoll ċertu ammont ta 'konċentrat, li jeħtieġ trattament xieraq biex jiġu evitati problemi ambjentali.
Biex jegħlbu dawn l-isfidi, ir-riċerkaturi qed jaħdmu biex jiżviluppaw materjali ġodda tal-membrana, bħal kisjiet antifouling u nanokomposti, biex itejbu d-durabilità u l-effiċjenza tal-membrana. L-ottimizzazzjoni tad-disinn tas-sistema u l-proċeduri operattivi tgħin ukoll ittejjeb il-prestazzjoni ġenerali tat-teknoloġija tar-reverse osmosis. Fil-futur, bl-avvanzi fix-xjenza tal-materjali u t-teknoloġiji tat-trattament tal-ilma, il-membrani tar-reverse osmosis huma mistennija li jkollhom rwol sinifikanti f'firxa usa 'ta' oqsma.